Neben makroskopisch-morphologischen Merkmalen werden heute immer mehr biochemische oder genetische Merkmale (DNA-Sequenzübereinstimmung usw.) zur Analyse der verwandschaftlichen Beziehungen eingesetzt. Bei Berücksichtigung vieler Merkmale sind Rückschlüsse auf verwandtschaftliche Zusammenhänge möglich. Aber auch innerhalb einer Kategorie stimmen keineswegs alle Merkmale überein, sondern es treten unterschiedliche Entwicklungs- oder Organisationsstufen auf.
Obwohl die Systematik heute weitgehend allgemein anerkannt ist, finden sich bei verschiedenen Autoren auch Abweichungen von der gängigen Einteilung.